Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccne1Q61457 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccne1Q61457 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccne1Q61457 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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