Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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BcanQ61361 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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BcanQ61361 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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BcanQ61361 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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BcanQ61361 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms