Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms