Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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