Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmub2Q3V209 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmub2Q3V209 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmub2Q3V209 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmub2Q3V209 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmub2Q3V209 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmub2Q3V209 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmub2Q3V209 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms