Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms