Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LcorlQ3U285 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms