Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Treml4Q3LRV9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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