Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Rpusd2Q149F1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Rpusd2Q149F1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Rpusd2Q149F1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Rpusd2Q149F1 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Rpusd2Q149F1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Rpusd2Q149F1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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