Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms