Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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