Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms