Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms