Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Otx2P80206 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms