Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf5P56477 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf5P56477 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms