Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms