Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5cP35278 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms