Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxa10P31310 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms