Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
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PtprqP0C5E4 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
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PtprqP0C5E4 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
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PtprqP0C5E4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
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PtprqP0C5E4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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PtprqP0C5E4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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PtprqP0C5E4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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PtprqP0C5E4 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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PtprqP0C5E4 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
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PtprqP0C5E4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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