Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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