Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms