Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Smarce1O54941 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Smarce1O54941 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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