Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EdaO54693 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EdaO54693 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms