Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Timm44O35857 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Timm44O35857 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Timm44O35857 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Timm44O35857 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Timm44O35857 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Timm44O35857 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Timm44O35857 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Timm44O35857 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Timm44O35857 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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