Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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MsmbO08540 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MsmbO08540 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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