Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm20939L7N243 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20939L7N243 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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