Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm17535J3KMR8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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