Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx60E9PZQ1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms