Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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