Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttll9A2APC3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms