Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms