Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trpc2Q9R244 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trpc2Q9R244 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trpc2Q9R244 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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