Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf4Q9QZS2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf4Q9QZS2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf4Q9QZS2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf4Q9QZS2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf4Q9QZS2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms