Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

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Length 761 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Phtf1Q9QZ09 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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