Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms