Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl28Q9JIL2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms