Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms