Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Cnot8Q9D8X5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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