Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PudpQ9D5U5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PudpQ9D5U5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PudpQ9D5U5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PudpQ9D5U5 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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