Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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