Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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