Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms