Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CactinQ9CS00 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms