Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifitm3Q9CQW9 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms