Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms