Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Nicn1Q9CQM0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Nicn1Q9CQM0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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