Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdm1Q9CQK3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdm1Q9CQK3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms