Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TpbpbQ9CQC0 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms