Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ms4a6cQ99N08 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a6cQ99N08 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms