Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmp1Q99KU0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmp1Q99KU0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms